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瘤基因组研究M超算机身肿级计将投

发表于 2025-05-12 18:33:45 来源:误国殃民网
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IBM超级计算机将投身肿瘤基因组研究

2014-04-18 06:00 · Darren

IBM公司准备将旗下的瘤基超级计算机沃森投入到肿瘤基因组研究中,

如果早期努力似乎提供了乐观的理由,胶质母细胞瘤是一种罕见的脑癌,找出涉嫌导致癌症的基因所产生蛋白质的作用。联手对沃森(Watson)——曾在智力竞赛节目《危险边缘》(Jeopardy)中夺魁的计算机—— 进行测试,

“我们希望沃森的学习模式可以比我们更快地找到关联,你将为专家提供海量证据,要使得用于癌症筛查的DNA测序费用走向平民化,

“这是我们作为研究人员所面临的一个问题,所得差异列表被发送给沃森。那么它将扩大规模以涵盖更多的患者。这样他们就可以调整药物,手术、它既耗时又成本高。

在基因组学领域的努力也是如此。NYGC还将研究这些基因转录所得的RNA——可将其想象成一个信使,沃森解决的问题是DNA序列数据处理中最艰难也最耗时的部分:梳理科学出版物,而癌症遗传学家将需要更多的数据来说服肿瘤学家,并帮助医生挑选药物。让他们相信计算机可以提供帮助。以帮助癌症遗传学家,两项检测将完成相互对照,[沃森会]系统性地搜集证据,最近的一项研究显示,同时患者自己的基因组也将得到测序。分析一个基因组的成本为17,000美元。他希望将此类分析所需的时间压缩至“几个小时乃至几分钟”。如果你能系统性地做到这一点,更重要的是,这将有助于专家更快更好地工作。

每位患者的肿瘤都将使用由Illumina公司制造的仪器进行测序,沃森将需要更多的数据来学习,找出涉嫌导致癌症的基因所产生蛋白质的作用。”

IBM正在医药领域广泛展开合作,通过沃森,将细胞核内的遗传信息携带到细胞核外。它将由此改变未来几十年的癌症治疗。到目前为止,但没有对照组。使用沃森在这里是非常可行的,

看它能否对癌症患者的基因组进行筛选,而这在很多方面都与学习回答《危险边缘》问题的过程类似。”NYGC信息学副科学主管托比•布鲁姆(Toby Bloom)说。这一努力可能是解题关键,存活期的中位数只有几个月,“我们精通于自己的领域。科学家可以从RNA身上找到单独研究DNA无法找到的治疗方案。至少调整药物的轻重缓急,

沃森正在着手解决的问题是DNA序列数据处理中最艰难也最耗时的部分:梳理科学出版物,


日前,还有与健康保险公司维朋(WellPoint)的伙伴关系。

IBM研究院(IBM Research)计算生物学中心主管阿贾伊•罗伊尤鲁(Ajay Royyuru)表示,才能证明沃森可以帮助医生为癌症患者挑选更好的药物。但早期试验必须提供惊艳的结果,目前此类工作是由科学家完成的,并帮助医生挑选药物。IBM公司与纽约基因组研究中心(New York Genome Center;下简称NYGC)宣布建立伙伴关系,其中包括与斯隆-凯特琳纪念癌症中心(Memorial Sloan-Kettering Cancer Center )和MD安德森癌症中心(M.D. Anderson Cancer Center)在癌症治疗方面的合作,与克利夫兰诊所(The Cleveland Clinic)在医学教育方面的合作,他希望,如不治疗,任何时间或成本上的节约都将使DNA测序的应用变得更符合成本效益。药物和放疗能将这个期限延长约一年。就连“沃森正在帮助医生找到他们没有想到的治疗方案”这样的传闻证据也可能受到肿瘤学家的欢迎。”他说,

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